Система образования ведет свой отсчет с 1918 года, когда комиссией Совета депутатов трудящихся под председательством члена РСДРП А.М. Дутовой принято решение об открытии в поселке школы.

В настоящее время сеть общеобразовательных учреждений города Котовска представлена 2 средними общеобразовательными школами, одна из которых с углубленным изучением отдельных предметов. Образовательный процесс осуществляется в 4 зданиях. На территории города функционируют  9 дошкольных образовательных учреждений (2 из них филиалы), 1 из которых  - Центр развития ребенка-детский сад. Система дополнительного образования детей представлена 3 спортивными  школами, Домом детского творчества. В период летних каникул работает загородный оздоровительный лагерь «Костер». Все образовательные учреждения находятся в муниципальной собственности. 100 % образовательных учреждений имеют государственную аккредитацию и лицензию на право осуществления образовательной деятельности.

В 2002 году создано муниципальное учреждение «Комбинат школьного питания», в обязанности которого входит организация питания в образовательных учреждениях. В 2006 году в результате реорганизации Ресурсного центра и Городского методического кабинета создано муниципальное учреждение «Информационно-методический центр». В 2010 году образовано муниципальное учреждение «Центр бухгалтерского обслуживания и материально-технического обеспечения муниципальных учреждений города».